Почему большинство рестрикционных ферментов режет в палиндромной последовательности?

Почему большинство рестрикционных ферментов режет в палиндромной последовательности?
Anonim

Ответ:

Потому что это более эффективно.

Объяснение:

Ферменты, такие как рестрикционные ферменты, должны распознавать очень специфическую последовательность, чтобы выполнить свою задачу. Он связывается с ДНК только в одной конкретной конфигурации. К счастью! потому что вам не нужен «пакман», который разрезает ДНК в случайных местах.

ДНК является двухцепочечной, поэтому у нее есть «две стороны», с которыми может связываться фермент. Палиндромная последовательность одинакова для обеих сторон (см. Изображение ниже). Это означает, что фермент распознает последовательность независимо от того, с какой стороны фермент приближается к ДНК.

Палиндромная последовательность также увеличивает вероятность того, что обе цепи ДНК будут разрезаны. Возможно даже, что два фермента работают как димер, чтобы разрезать палиндромную последовательность, еще более увеличивая эффективность.

Последняя причина была важна в борьбе между вирусами и бактериями. Бактерии эволюционировали, чтобы «отключить» бактерии-нацеленные вирусы (бактериофаги), используя рестрикционные ферменты, которые связываются с этими палиндромными последовательностями. Разрезание обеих нитей ДНК вредит вирусу больше, чем разрезание одной пряди.